Kościół w Makowie Podhalańskim został 12. świątynią jubileuszową w archidiecezji krakowskiej.
4 lutego metropolita krakowski Kard. Stanisław Dziwisz, dołączył sanktuarium makowskie do listy świątyń archidiecezji krakowskiej, za których nawiedzenie można uzyskać odpust zupełny w związku z obchodami Nadzwyczajnego Jubileuszu Miłosierdzia.
Jak podaje archidiecezja krakowska obecnie jest już w diecezji 12 kościołów, w których można uzyskać jubileuszowy odpust. Poza Makowem Podhalańskim, są to: katedra na Wawelu, sanktuarium Miłosierdzia Bożego w Łagiewnikach, sanktuarium św. Jana Pawła II na Białych Morzach, bazylika Mariacka w Krakowie, opactwo cystersów w Mogile, sanktuarium MB Anielskiej w Kalwarii Zebrzydowskiej, bazylika Ofiarowania NMP w Wadowicach, kościół św. Piotra Apostoła w Wadowicach, bazylika w Trzebini, kościół NSPJ w Nowym Targu i kościół Świętej Rodziny w Zakopanem.